Источник http://www.mysql.ru/docs/man/Repair.html
Стадия 1: проверка таблиц
Выполните myisamchk *.MYI или, если вы располагаете временем, myisamchk -e *.MYI. Используйте опцию -s (молчаливый режим) для подавления ненужной информации.
Если mysqld остановлен, то следует использовать опцию --update-state для указания myisamchk отмечать таблицы как 'проверенные'(checked).